巴克纳尔大学有两个学院——艺术与科学学院，工程学院。为学生提供53门主修课程，64门辅修课程。除此之外，还为学生提供其他相关课程，包括统计与管理学，教育学，声乐。以及职前教育课程，包括法学和医药学。该大学的28个科系都本着提供最优质的教学质量的态度给学生提供教育。

　　艺术及科学学院－按照传统的分支方法，将课程分为人文学，社会科学，自然科学和数学三大部分。

　　工程学院——该学院主要提供六个专业方向的课程，包括生物医学工程，化学工程，城市与环境工程，电子工程，医药工程和计算机科学。

　　美国巴克纳尔大学专业

　　本科：动物行为学，人类学，艺术和艺术史，生物，细胞生物学与生物化学，化学，比较人文学科，计算机科学，东亚研究，经济学，经济与经济数学，教育学，工程管理学，英语，环境地质学，环境研究，法语，地理，地质情况，德语，历史，国际关系研究，拉丁美洲研究，神经系统科学，数学，音乐，哲学，物理，政治学，宗教，俄语，社会学，西班牙语，戏剧，女性与性别研究，会计，管理。

　　研究生：动物行为，化学，生物，数学，心理学，土木工程，化学工程，电子工程，环境工程，机械工程。